Mini-projet 2024-25 : Arbres phylogénétiques


But

Le but de ce mini-projet est de vous faire pratiquer les éléments de programmation vus au cours du semestre. Il vous permettra également la mise en oeuvre concrète de concepts vus plus formellement dans le cadre de la partie théorique du cours (programmation dynamique, représentations des données etc.).


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images tirées de : https://www.slate.fr/story/107109/scientifiques-tree-life et https://en.wikipedia.org/wiki/File:Phylogenetic_tree.svg

Enoncé et mise en place

Ce projet a pour but de vous faire implémenter des algorithmes de constructions d'arbres phylogénétiques. Il vous permettra de pratiquer l'essentiel des concepts de programmation dans la partie pratique du cours et d'expérimenter des algorithmes d'exploration de graphe.

Le projet sera réalisé par groupes de deux personnes (il est possible de le faire seul si vous le souhaitez, mais ce n'est pas recommandé).

Le rendu est fixé au Mercredi 18 Décembre 13h00. Les instructions pour le rendu vous seront communiquées en temps voulu.

Commencez par prendre connaissance de l'énoncé complet [Lien].
[An english translation is provided. It was generated using a tool for automatic translation, then proofread.
The reference document is however the French version. In case something is unclear in the English version please refer to the French one or ask questions].

Création du projet

Une partie du matériel est fournie : phylogenetic.zip. Ce tutoriel est mis à votre disposition pour installer ce matériel pour QtCreator ou Geany. .

L'énoncé vous indique quel fichier compléter et comment.

Barème

Il y a trois étapes à compléter pour la réalisation de ce mini-projet. La grille ci-dessous vous donne la répartition des points par étape.

points Maximum possible sur 6
Fonctions utilitaires
(étape 1)
30 2.5

Gestion des structures de données
(étape 2)
35 4.25
Arbres phylogénétiques
(étape 3)
35 6

Important:

Le projet est un élément noté. L'échange d'idée entre groupes ou avec des tiers est autorisée et même recommandée. Par contre, l'échange de code est strictement interdit ! Le plagiat de code, qui sera contrôlé, sera considéré comme de la tricherie. En cas de tricherie, vous recevrez la note «NA» (voir également l'ordonnance sur la discipline). Dans tous les cas, il est fortement conseillé de pouvoir expliquer les lignes de code de son projet.